Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF556Q9HAH1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms