Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NANOGQ9H9S0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NANOGQ9H9S0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGQ9H9S0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGQ9H9S0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGQ9H9S0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NANOGQ9H9S0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms