Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NHEJ1Q9H9Q4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHEJ1Q9H9Q4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms