Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C10orf88Q9H8K7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C10orf88Q9H8K7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms