Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf33Q9H7E9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf33Q9H7E9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C8orf33Q9H7E9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C8orf33Q9H7E9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms