Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
REEP4Q9H6H4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REEP4Q9H6H4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REEP4Q9H6H4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms