Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLMPQ9H6B4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLMPQ9H6B4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms