Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABEP2Q9H5N1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RABEP2Q9H5N1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP2Q9H5N1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP2Q9H5N1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms