Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM12Q9H4Q4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM12Q9H4Q4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM12Q9H4Q4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms