Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIBC2Q9H4K1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIBC2Q9H4K1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms