Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRABDQ9H4I3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRABDQ9H4I3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRABDQ9H4I3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABDQ9H4I3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms