Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB17Q9H0T7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB17Q9H0T7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB17Q9H0T7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB17Q9H0T7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB17Q9H0T7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB17Q9H0T7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB17Q9H0T7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB17Q9H0T7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB17Q9H0T7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB17Q9H0T7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB17Q9H0T7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB17Q9H0T7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms