Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP3Q9BZ76 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP3Q9BZ76 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms