Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTRT3Q9BYD9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTRT3Q9BYD9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms