Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD1Q9BXT4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD1Q9BXT4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms