Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCRT1Q9BWW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCRT1Q9BWW7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCRT1Q9BWW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.9 ms