Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNPPD1Q9BV87 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPPD1Q9BV87 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPPD1Q9BV87 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms