Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNPY3Q9BT09 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPY3Q9BT09 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNPY3Q9BT09 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNPY3Q9BT09 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms