Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCM2Q9BSQ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCM2Q9BSQ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCM2Q9BSQ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCM2Q9BSQ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCM2Q9BSQ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCM2Q9BSQ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCM2Q9BSQ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCM2Q9BSQ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCM2Q9BSQ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCM2Q9BSQ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCM2Q9BSQ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms