Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NICN1Q9BSH3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NICN1Q9BSH3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NICN1Q9BSH3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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