Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM79Q9BSE2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM79Q9BSE2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM79Q9BSE2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM79Q9BSE2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM79Q9BSE2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM79Q9BSE2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM79Q9BSE2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM79Q9BSE2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM79Q9BSE2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.2 ms