Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIKE1Q9BRV8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIKE1Q9BRV8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIKE1Q9BRV8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms