Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM246Q9BRR3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM246Q9BRR3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms