Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC77Q9BR77 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC77Q9BR77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms