Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP1Q9BPW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP1Q9BPW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms