Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARD1Q99728 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARD1Q99728 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms