Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PFDN5Q99471 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PFDN5Q99471 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms