Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNKPQ96T60 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNKPQ96T60 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNKPQ96T60 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms