Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPP1R9BQ96SB3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPP1R9BQ96SB3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPP1R9BQ96SB3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms