Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KC1Q96S38 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPS6KC1Q96S38 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPS6KC1Q96S38 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KC1Q96S38 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms