Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGS1Q96RS0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGS1Q96RS0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGS1Q96RS0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms