Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CITED4Q96RK1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CITED4Q96RK1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms