Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RUNDC3BQ96NL0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNDC3BQ96NL0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC3BQ96NL0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms