Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOPNLQ96NB1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOPNLQ96NB1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FOPNLQ96NB1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOPNLQ96NB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOPNLQ96NB1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOPNLQ96NB1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOPNLQ96NB1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOPNLQ96NB1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOPNLQ96NB1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms