Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSNARE1Q96NA8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1Q96NA8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSNARE1Q96NA8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1Q96NA8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms