Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF578Q96N58 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF578Q96N58 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF578Q96N58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF578Q96N58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms