Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG8Q96MW5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG8Q96MW5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms