Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALR3Q96L12 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALR3Q96L12 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALR3Q96L12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALR3Q96L12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms