Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBED3Q96IU2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZBED3Q96IU2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZBED3Q96IU2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZBED3Q96IU2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms