Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUB1Q96FW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms