Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXorf40BQ96DE9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXorf40BQ96DE9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXorf40BQ96DE9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms