Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMD3Q96D46 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NMD3Q96D46 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMD3Q96D46 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms