Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARVELD3Q96A59 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARVELD3Q96A59 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MARVELD3Q96A59 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MARVELD3Q96A59 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MARVELD3Q96A59 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms