Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC102AQ96A19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC102AQ96A19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms