Protein–RNA interactions for Protein: Q969X1

TMBIM1, Protein lifeguard 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM1Q969X1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMBIM1Q969X1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMBIM1Q969X1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMBIM1Q969X1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms