Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEIL2Q969S2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL2Q969S2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEIL2Q969S2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms