Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TNFRSF25Q93038 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFRSF25Q93038 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF25Q93038 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF25Q93038 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms