Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATRIPQ8WXE1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATRIPQ8WXE1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATRIPQ8WXE1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATRIPQ8WXE1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms