Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUFY2Q8WXA3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUFY2Q8WXA3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUFY2Q8WXA3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms