Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHIPQ8WWQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHIPQ8WWQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHIPQ8WWQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHIPQ8WWQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHIPQ8WWQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHIPQ8WWQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHIPQ8WWQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHIPQ8WWQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms